2021年新一代测序（NGS）技术培训班
暨第四届全国NGS建库及创新大赛通知

各医疗机构（临床实验室）：

NGS（新一代测序）结合其他分子生物学技术，在生物医药领域发挥了越来越重要的作用，各种基于NGS的创新研究及其应用越来越广。随着新的《医疗器械监督管理条例》正式实施，为了适应NGS实验室和实验室自建方案的实验人员要求,上海市临床检验中心和上海市遗传学会共同主办，长三角罕见病实验诊断协作中心、上海市实验医学研究院和国家卫健委出生缺陷与生殖健康重点实验室协办的“2021年新一代测序技术培训班暨第四届全国NGS建库及创新大赛”将分别于2021年9月24-25日对医疗机构实验室操作人员进行理论培训，9月26日-29日进行实操培训。

学员经考试合格后由上海市临床检验中心和上海市遗传学会联合颁发《新一代测序NGS技术培训合格证书》。

现将培训班有关事项通知如下：

一、培训对象:

全国各医疗机构临床实验室具有PCR上岗证人员，限额150名，额满为止。

二、培训时间:

1、理论培训时间：2021年9月24日-25日；

2、实操培训时间：2021年9月26日-29日分组举行，每组1天。

三、理论培训地点:

1、理论培训：上海青松城大酒店4楼劲松厅（上海市徐汇区东安路8号，地铁9号线肇嘉浜路站;）

2、实操培训：杨浦区城投宽庭湾谷社区科技园；杨浦区国权北路1566号25号-28号E7；

四、培训内容:(见附件)

五、培训要求：

理论考试成绩满分为100分，须达到70分以上为合格。实操考核满分100分，须达到60分以上为合格。两项考核均合格者于2021年10月下旬颁发《新一代测序NGS技术培训合格证书》。

六、培训费用及报名方式：

1．培训费用：每人3000元，含实验操作培训。

2．报名方式：参加培训人员可登陆www.sccl.org.cn网站填写报名信息，填写后可直接在线支付，并保留好付款单号以备查。

3．注意事项：此次培训不接受现场报名和付款。

七、报名截止日期：2021年9月23日

八、食宿安排：

培训期间午餐由主办方提供，其余自理；住宿自理。

需住宿人员推荐宾馆： 上海青松城大酒店（上海市徐汇区东安路8号，地铁9号线肇嘉浜路站）

九、会务组联系方式：

联系人：李羽  68316300*1364  王晋 68316300*1203

联系人： 陈俊  微信：18964501851，电话：13564953309

主办单位：上海市临床检验中心  

上海市遗传学会      

                协办单位：长三角罕见病实验诊断协作中心

                                              上海市实验医学研究院

                                              国家卫健委出生缺陷与生殖健康重点实验室

2021年7月21日

附件：

理论培训课程安排

实验操作培训部分

1、实验操作培训方法：

1) 实操前安排1小时的实验操作带教讲解。

2) 实验讲解后每组人员须独立完成考核样本的建库实验。

3) 由培训方将建库完成后的考核样本统一文库质检复测。

4) 生信分析和模拟诊断报告由主办方采用测序下机文件（FASTQ）在云盘上传，理论培训结束后自行下载由学员进行数据分析，并于2021年10月22日前完成模拟诊断报告（限PDF格式）交主办方。

5) 移液枪由学员自带，考核样本由培训方提供，建库试剂盒由培训方提供。

6) 实操地点：杨浦区城投宽庭湾谷社区科技园；杨浦区国权北路1566号25号-28号E7；具体分组见第二轮通知。

 2、检测样本：

1）肿瘤FFPE样本4个

第四届全国NGS建库及创新大赛通知

主办单位：上海市遗传学会、中国遗传学会遗传诊断分会、上海市临床检验中心

协办单位：长三角罕见病实验诊断协作中心、上海市实验医学研究院、国家卫健委出生缺陷与生殖健康重点实验室

参赛对象： 全国各医疗机构临床实验室，限额150名（优先考虑临床医院具有PCR实验室上岗证人员组队报名）

举办目的：

随着高通量新一代测序技术（NGS）的发展和成熟，当前的医疗模式迈向了新的精准医学模式。目前NGS技术已经开始应用于常规临床实践，应用领域包括无创产前检测、肿瘤、胚胎植入前遗传学诊断/筛查、遗传病、药物基因组等。为了促进NGS临床应用，提升业内人员的NGS建库技能与质量控制，2018年至2020年中国遗传学会遗传诊断分会、上海市临床检验中心、上海市遗传学会成功地联合举办了三届全国NGS建库技能大赛。大赛为NGS技术在临床应用以及推动诊断技术创新升级提供了良好的交流平台，助力我国医疗诊断产业的前行发展。

第四届全国NGS建库及创新大赛 （The Fourth National NGS Library Preparation Skills Competition NLPSC，以下简称“大赛”） 将于 2021 年7月正式启动。大赛组委会经与上海市临床检验中心、上海市遗传学会沟通交流，决定本届大赛与“2021年新一代测序NGS 技术培训班”联合举办。培训者经考试合格后将获上海市临床检验中心颁发的合格证书，将于同时理论和实验操作总分表现优秀的学员直接获得本次大赛的参赛资格，其中实验操作成绩按40%自动计入大赛总成绩。

获得资格的参赛队将参加“NGS建库创新设计活动”及 “NGS理论知识竞赛”。 大赛邀请行内业知名专家学者参与全程评审，最终按照总成绩评出获奖团队，并对参赛团队进行奖励和表彰。

NGS建库技能创新设计活动：（占总成绩40%）

  参赛队根据各自对NGS建库知识的了解，从组委会指定的设计题目中任选一题，设计相应方案，并进行原理说明和阐述，建议1500字左右，并于2021年10月22前发送给组委会。组委会将邀请专家组成评审委员会将进行专项评审，并以无记名方式对方案进行打分，各队的方案以平均分计入总成绩

创新设计题目如下:（任选一题）

1、  肿瘤ctDNA建库时面临的最大挑战是对低频突（<0.2%）的检测，请设计一种具有创新性的低  频突变NGS检测方案，描述其原理并论证其可行性。

2、 由于存在重复基因、假基因，以及复杂的基因组结构变异，目前常规的短读长的NGS技术在检测罕见病或遗传病的致病基因方面还存在一定的盲区，请你设计一些研究方案，在基于NGS基础上，并结合其他遗传学研究方法，进一步提高遗传病致病基因的检出率。

3、 针对感染性疾病筛查和检测的宏基因组NGS（mNGS）目前已经在临床中应用，但是存在mNGS的目标测序比例低，无关序列干扰太多，同时存在容易污染、病原体信息混杂和解读判断困惑问题，请你设计一些研究方案，更好的解决上述问题。

4、 其他利用NGS技术，在生物医药中解决各种基础与临床中的难点和痛点问题的设计方案。

NGS理论知识竞赛的方案: （占总成绩20%）

NGS理论知识竞赛将于2021年11月19日“上海市遗传学会年会”和“中国遗传学会遗传诊断分会年会”的分会场举行，主要考察参赛队伍对NGS技术（包含组织NGS检测，液态活检，NGS检测过程中常见问题等）的理论和临床应用认知程度，以现场考卷和现场抢答的形式进行，题型为必答题和抢答题，共50题，必答题20道，抢答题30道。知识竞赛成绩占总分的20%。比赛成绩及结果将在现场公布。

一、参赛须知：

1. 参赛队伍：以本次参加“2021年新一代测序NGS技术培训班”所有人员作为对象，遴选标准：培训班的实操考核成绩前20组队伍直接获得大赛参赛资格，参加NGS建库创新设计方案活动和 “NGS理论知识竞赛”。

2. 大赛实操成绩（初赛）直接采用“2021年新一代测序NGS技术培训班”的实操成绩。实操成绩占总分的40%、方案设计占总分的40%、理论知识竞赛占总分的20%。

3. NGS理论知识竞赛为决赛部分，主要考察参赛队伍对NGS技术（包含组织NGS检测，液态活检，NGS检测过程中常见问题等）的理论和临床应用认知程度，以现场考卷和现场抢答的形式进行，题型为必答题和抢答题，共50题，必答题20道，抢答题30道。知识竞赛成绩占总分的20%。比赛成绩及结果将在现场公布。

4. 知识竞赛时间（暂定）：2021年11月19日。

5. 大赛颁奖时间（暂定）：2021年11月20日。

二、奖励办法：

1. 一等奖：1个（5000元）

2. 二等奖：3个（各3000元）

3. 三等奖：5个（各2000元）

4. 优胜奖：11个（各500元）

单项奖如下：

1. 优秀设计奖：1个（3000元）

2. 知识竞赛奖：1个（2000元）

三、 联系方式：

联系人： 陈俊  微信：18964501851，电话：13564953309

本次NGS建库及创新大赛活动的最终解释权归主办方“第四届全国NGS建库及创新大赛组委会”所有。

 2021年7月21日

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